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最大規模7,609人の日本人全ゲノム配列を集めて解析したバリアント頻度パネルGEM Japan Whole Genome Aggregationの公開

【発表のポイント】

  • 东北メディカル?メガバンク计画、理化学研究所および东京大学医科学研究所バイオバンク?ジャパンが収集した多机関からの日本人の全ゲノム配列データを统合、再解析し、日本の様々の地域を反映したゲノム情报のパネルを作成
  • 全ゲノム配列情报をもとに日本人集団として最大规模のサンプル数を有するバリアント频度パネルを公开
  • 稀少疾患研究や単一遗伝子疾患の个别化医疗応用に有用な基础的データを公开
  • 日本人に関するバリアント频度パネルの公开により、これまで未知、未解明だった日本人特异的な稀少疾患や単一遗伝子疾患の病因解明に期待

【概要】

東北大学東北メディカル?メガバンク機構(ToMMo)、岩手医科大学いわて東北メディカル?メガバンク機構(IMM)、理化学研究所および東京大学医科学研究所は共同研究を実施し、計7,609人分のバリアントを含むバリアント頻度情報について、非制限公開データの GEM Japan Whole Genome Aggregation(GEM-J WGA)パネルとして、科学技術振興機構(JST)バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)のTogoVarより2020年7月27日から公開します(図)。これらのデータは、ToMMoおよびIMMの持つ4,495人分の全ゲノム配列(Whole Genome Sequence: WGS)情報と理化学研究所および東京大学医科学研究所が持つバイオバンク?ジャパン(BBJ)の3,114人分のWGS情報を合わせた計7,609人分のWGS情報を用いてバリアント検知を実施して得られたものです。また、解析する際に得られた個人ごとのゲノム配列を参照ゲノム配列にマッピングした結果およびバリアント情報は、制限公開/制限共有データとして、国立遺伝学研究所生命情報?DDBJセンターのJGA/AGDより近日中に公開する予定です。

図.TMM、BBJの全ゲノムデータを再解析してGEM-J WGAパネルを作成するまでの流れ

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问い合わせ先

東北大学 東北メディカル?メガバンク機構 広報?企画部門
TEL:022-717-7908
FAX:022-717-7923
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